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Academicforge:研究点开即用按需配置的一站式学术研究平台

GitHub |2026-07-04

One Forge, All Skills: A curated skill collection 为 academic writing、研究. 点开即用,按需配置的一站式学术研究 skills 平台。GitHub 2,079 ⭐ / 127 Fork,主要使用 Python 开发。标签:ai,ai-for-research,research-tool,scientific-agents,skills。访问项目:https://github.com/HughYau/AcademicForge

项目介绍

One Forge, All Skills: A curated skill collection 为 academic writing、研究. 点开即用,按需配置的一站式学术研究 skills 平台。

核心功能

- 指南:`https://hughyau.github.io/AcademicForge/agents.md` - 瘦索引:`https://hughyau.github.io/AcademicForge/index.slim.json` - 完整 registry 镜像:`https://hughyau.github.io/AcademicForge/skills.json`

使用指南

curl -sSL https://raw.githubusercontent.com/HughYau/AcademicForge/refs/heads/site-first/scripts/forge-install.sh | bash -s -- \ --tool claude \ --skills humanizer,superpowers ```

Windows PowerShell:

``` cd your-project $script = Join-Path $PWD 'forge-install.ps1' Invoke-WebRequest -Uri 'https://raw.githubusercontent.com/HughYau/AcademicForge/refs/heads/site-first/scripts/forge-install.ps1' -OutFile $script & $script -Tool claude -Skills 'humanizer,superpowers' Remove-Item $script ```

已安装的同名 skill 会被跳过并提示;追加 `--force`(PowerShell 为 `-Force`)可覆盖更新。

🤖 方式三:让你的 AI 替你挑选

不知道选什么?把下面这段提示词交给你的 AI 智能体(Claude Code / OpenCode / Codex 均可):

> 请获取并阅读 https://hughyau.github.io/AcademicForge/agents.md,按其中的说明了解我的研究需求,然后从 AcademicForge 目录中为我挑选合适的学术 skills 并生成安装命令。

站点右下角的「不知道选什么?」卡片可以一键复制(会自动带上你已选择的工具与平台)。智能体可读的目录索引:

- 指南:`https://hughyau.github.io/AcademicForge/agents.md` - 瘦索引:`https://hughyau.github.io/AcademicForge/index.slim.json` - 完整 registry 镜像:`https://hughyau.github.io/AcademicForge/skills.json`

验证安装:

``` ls .claude/skills/ ls .opencode/skills/ ls .codex/skills/ ```

📦 本地维护内容

`site-first` 分支中,保留在仓库内本地维护的内容有:

- `skills/scientific-visualization` — 单个本地 skill - `skills/claude-science` — Claude Science(Anthropic)内置技能集合,共 32 个技能。作为集合根归类在「流程与方法(Workflow & Process)」下、名为 Claude Science、作者 Anthropic;其下每个子技能再按科研 / 写作 / 图表等分类。因为直接托管在本仓库,所以无需订阅 Claude Science 即可通过 sparse-checkout 安装,跨 agent 通用并支持 Windows

编辑该目录后,用以下命令仅重建此集合的索引(无需联网克隆其他集合):

``` node scripts/build-skill-index.mjs --only claude-science node scripts/build-slim-index.mjs ```

其他 pack 都通过 `registry/skills.json` 描述,并在安装时从各自来源仓库获取。

🔬 Claude Science 技能清单(32 个)

下面按主题整理了 [`skills/claude-science`](./skills/claude-science) 收录的全部 32 个技能。只想安装这一套:

``` curl -sSL https://raw.githubusercontent.com/HughYau/AcademicForge/refs/heads/site-first/scripts/forge-install.sh | bash -s -- --tool claude --skills claude-science ```

六大主题:🧬 结构预测与对接 · ✏️ 蛋白质设计与嵌入 · 🧫 基因组与单细胞 · 📊 图表与可视化 · ✍️ 文献与写作 · ⚙️ 算力与工作流

<details> <summary><b>展开查看全部 32 个 Claude Science 技能</b></summary>

🧬 结构预测与对接(6)

Skill用途
[alphafold2](./skills/claude-science/alphafold2)AlphaFold2 / AF2-Multimer 折叠单体与复合物(ColabFold 运行器)
[openfold3](./skills/claude-science/openfold3)AlphaFold3 的开源权重 PyTorch 复现(AlQuraishi Lab)
[boltz](./skills/claude-science/boltz)Boltz-2 预测蛋白 / 核酸 / 小分子复合物,可选结合亲和力
[chai1](./skills/claude-science/chai1)Chai-1 基础模型预测抗体-抗原、蛋白-配体复合物
[esmfold2](./skills/claude-science/esmfold2)Biohub ESMFold2 / ESMFold2-Fast 全原子共折叠
[diffdock](./skills/claude-science/diffdock)DiffDock-L 预测小分子结合构象(分子对接)

✏️ 蛋白质设计与嵌入(4)

Skill用途
[proteinmpnn](./skills/claude-science/proteinmpnn)对蛋白骨架逆折叠生成氨基酸序列
[ligandmpnn](./skills/claude-science/ligandmpnn)带配体 / 核酸 / 金属上下文的逆折叠
[solublempnn](./skills/claude-science/solublempnn)面向可溶性重训的 ProteinMPNN 变体
[fair-esm2](./skills/claude-science/fair-esm2)用 Meta ESM-2 生成蛋白质嵌入表征

🧫 基因组与单细胞(4)

Skill用途
[borzoi](./skills/claude-science/borzoi)从 DNA 序列预测全基因组功能轨迹(RNA-seq/CAGE/DNase/ChIP)
[evo2](./skills/claude-science/evo2)长上下文基因组基础模型:打分 / 嵌入 / 生成 DNA
[scgpt](./skills/claude-science/scgpt)单细胞基础模型 scGPT:嵌入与细胞注释
[scvi-tools](./skills/claude-science/scvi-tools)概率式单细胞 RNA-seq(scVI / scANVI + 贝叶斯差异表达)

📊 图表与可视化(4)

Skill用途
[figure-composer](./skills/claude-science/figure-composer)组合出版级多面板图
[figure-style](./skills/claude-science/figure-style)出版级图表正确性与可读性规范
[algorithmic-art](./skills/claude-science/algorithmic-art)用 p5.js 创作算法 / 生成艺术
[web-artifacts-builder](./skills/claude-science/web-artifacts-builder)构建复杂的 claude.ai HTML 交互产物(React/Tailwind/shadcn)

✍️ 文献与写作(4)

Skill用途
[literature-review](./skills/claude-science/literature-review)检索、核验并综合科学文献
[paper-narrative](./skills/claude-science/paper-narrative)审视并重塑论文图表讲述的“故事线”
[indication-dossier](./skills/claude-science/indication-dossier)生成治疗适应症档案(indication dossier)
[pdf-explore](./skills/claude-science/pdf-explore)跨整篇 PDF / 论文定位、比较与抽取内容

⚙️ 算力与工作流(10)

Skill用途
[compute-env-setup](./skills/claude-science/compute-env-setup)在远程算力上搭建运行环境
[remote-compute-modal](./skills/claude-science/remote-compute-modal)在你自己的 Modal 账户上运行 GPU 任务
[remote-compute-ssh](./skills/claude-science/remote-compute-ssh)SSH / SLURM 主机的提交 → 等待 → 回收工作流
[managed-model-endpoints](./skills/claude-science/managed-model-endpoints)注册本地 / 远程模型服务端点
[using-model-endpoint](./skills/claude-science/using-model-endpoint)通过原生 HTTP API 调用已注册的模型端点
[self-awareness](./skills/claude-science/self-awareness)对 Claude Science 会话数据库 / SDK 做自省
[skill-creator](./skills/claude-science/skill-creator)创建、改进并评测 skill
[customize](./skills/claude-science/customize)自定义 agent 画像并创作新 skill
[learn](./skills/claude-science/learn)面向“理解原理”的学习 / 讲解型 skill
[product-self-knowledge](./skills/claude-science/product-self-knowledge)涉及 Anthropic 产品事实时先自查核对

</details>

🛠️ 维护 `site-first`

常用本地命令:

``` npm run site:install

项目信息

项目信息
项目名称HughYau/AcademicForge
Star 数2,079
Fork 数127
编程语言Python
开源协议NOASSERTION
创建时间2026-02-03
最近更新2026-07-03
主题标签ai、ai-for-research、research-tool、scientific-agents、skills

项目地址

GitHub 仓库:<https://github.com/HughYau/AcademicForge>

> 完整 URL:[https://github.com/HughYau/AcademicForge](https://github.com/HughYau/AcademicForge)

如需查看完整源码、安装命令、使用示例、API 文档,请直接访问上方项目地址。所有信息均以 GitHub 仓库为准。